Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms