Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SrfQ9JM73 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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