Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rabgef1Q9JM13 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rabgef1Q9JM13 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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