Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms