Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 1700084J12Rik-202ENSMUST00000187707 1992 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm9341-201ENSMUST00000183000 986 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms