Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp12Q9D9M2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms