Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc83Q9D4V3 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms