Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tubgcp4Q9D4F8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tubgcp4Q9D4F8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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