Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms