Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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