Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms