Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tsnaxip1Q99P25 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms