Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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