Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms