Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lrit1Q8K099 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms