Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Card11Q8CIS0 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Card11Q8CIS0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Card11Q8CIS0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Card11Q8CIS0 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms