Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms