Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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