Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cdca8Q8BHX3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cdca8Q8BHX3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms