Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms