Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms