Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ifit1Q64282 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms