Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms