Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kdm4dQ3U2K5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms