Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf149Q3U2C5 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rnf149Q3U2C5 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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