Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ttc21bQ0HA38 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc21bQ0HA38 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ttc21bQ0HA38 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms