Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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NfiaQ02780 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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