Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Top2aQ01320 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top2aQ01320 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top2aQ01320 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Top2aQ01320 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms