Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zc3h10-201ENSMUST00000040572 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Lpin1-205ENSMUST00000221297 3100 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cbx1P83917 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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