Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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