Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms