Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcntP48725 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Dhcr7-201ENSMUST00000073878 2815 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcntP48725 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcntP48725 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms