Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VdrP48281 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
VdrP48281 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
VdrP48281 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms