Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm20281-201ENSMUST00000188225 267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pou3f3P31361 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms