Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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