Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC154264.2-201ENSMUST00000216569 403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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