Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TP20293 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TP20293 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TP20293 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TP20293 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms