Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nfatc1-201ENSMUST00000035800 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms