Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms