Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Tgfb1P04202 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms