Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC024978J3QPC3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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BC024978J3QPC3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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BC024978J3QPC3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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BC024978J3QPC3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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BC024978J3QPC3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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