Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprbB2RU80 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms