Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms