Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pole3Q9JKP7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms