Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim39Q9ESN2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim39Q9ESN2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim39Q9ESN2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim39Q9ESN2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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