Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Wdr61Q9ERF3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms