Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rnf6Q9DBU5 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf6Q9DBU5 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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