Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Med27Q9DB40 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms