Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ighm-202ENSMUST00000177715 1698 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms