Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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